Single молекуласы технологиядагы Жетекчилер
сезгичтиги, тез жана жеткиликтүү болгон ырааттуулукта өлчөмү боюнча чектөөлөргө карабастан, PNAS сүрөттөлгөн жаңы тизмек ыкмасы романы жана анын технологияларына каражат жөнүндө тар.ил.кандидаты жакын ишкана капиталисттердин көз кармаш үчүн жетиштүү убада көрсөттү. Бул изилдөө, доктор Тиметей Харрис узак убакыт кызматкери жана улук директору ылайык биринчи эле ишкана салым эмне издеп болгон техника жөнүндө бир нерсе болушу керек эле ... ишкана салым адатта мамиле эмес, окумуштуулар, аны башка жол жок!
PNAS Басылма 1-апрелде жарык көргөн, 2003-жыл, 2003-жылы бир жаңы компания, 19-декабрда козголгон каржылоонун биринчи турда, жана 2 лагери, 2004, Helicos ичинде доктор Харрис 5 кызматкерлери менен анын эшиктерин ачып, бир өлчөө илим жана бир молекула технологиясы боюнча адис. Helicos Азыркы Кембридж М.А., АКШда жайгашкан жана салымдардын каржылоонун 2 тур кийин, 27-май, 2007-жылдын боюнча IPO эле, ал эми азыр ачык NASDAQ алкагында соода турат: ОБКнын.
Helicos, атап айтканда, генетикалык анализ технологиялар боюнча адис, 2008-жылы апрелде атайын tSMS TM платформа илимий журналынын сүрөттөлгөн M13 вирус генетикалык тартибин менен бекитиле турган чыныгы жалгыз бир молекула тартипке (tSMS TM) технологияны, HeliScope TM Single колдонот молекула Sequencer.
Доктор Харрис айтымында, бул долбоор 2004-жылы башталган, ал эми 2005-жылдын июнунан, алар ийгиликтүү илим кагазда сүрөттөлгөн M13 жуктуруп, бир medically тиешелүү тизмегин, суроодон турган болчу.
TSMS TM кантип иштейт?
ДНК тууралуу 100-200 тепкичтүү бир катарлуу менен майда бөлүктөргө кесип жатат чектөө энзимдерди жана жар Куйруктары кошулат. Кыскартылган катар анын бетине байланышкан polyT чынжыр миллиарддаган бар Helicos клетка плитасына, ал инкубатордо жатышат. Ар бир инкубатордо шаблон замат суроодон турган болот. Ошондуктан акыр күнүнө миллиарддаган окуса болот. Labeling 4 нуклеотид базаларды ар бири үчүн, "quads" 4 ирекет ар бир турган, жүзөгө ашырылат. Fluorescent-белгиленген негиздер кошулат, жана инструмент боюнча лазер катар ошол ачаар базасын алган бир оку алуу, жазуучу жарык чачат. этикеткасы анда жабышып, жана кийинки цикл бир жаңы базасы менен башталат жатат. клетка ар базасы (4 мерчем) менен мамиле кийин, төрттүк топ толугу менен, ал эми жаңы бир башталгыч нуклеотид базасы менен кайра башталат.
Учурда, HeliScope TM узундугу болжол менен 55 база жубунан ДНК бөлүгүн окуй алат. кезек менен көбүрөөк негиздери, бир катар токтоткула, анткени, үлгү колдонулушу мүмкүн төмөнкү катардын пайыздык учурунда узарат үчүн.
20 же андан көп негиздерин окуп үчүн катардын 86% колдонсо болот. узун (55 Анткени база жуптарынын) окуп бул пайыздык 50% га чейин төмөндөйт.
Бир молекула артыкчылыктары
бир катар башка компаниялар жогорку өткөрүү аянтчалар ар кандай бир тизмек менен синтези технологияларын сунуш, ал эми ар кандай реагенттер, салыштырмалуу чыгымдар боюнча, алардын патенттелген менен бир учурда ДНК тизмегинин бир нуклеотидди гана Helicos окуп, 25-40 база жубунан окуп кыска үчүн уруксат берүү үчүн жетиштүү сезгич келет этикеткалоо ыкмасы бир молекуланын боюнча окуйт. Башка ыкмалар ДНК (колдонуу күчөтүлгөн талап УРК ) тартибин чейин нускалардын бир нече (миллиондогон) үчүн. Бул полимераз тарабынан каталарды кайра иштетүү үчүн так бир кыйла даражада мүмкүнчүлүктөрүн киргизет энзимдердин зайым учурунда.
2008-жылдын апрелиндеги абал HeliScopeTM күнүнө нуклеотид базаларды миллиарддаган кезегине кабарларга алган.
Helicos Жекелештирилген Medicine бирикмесинин мүчөсү болуп саналат жана "$ 1000 геному" гранттык каржылоого алган. бир күндүн ичинде $ 1000 геномунун саатына негиздери миллиарддаган иштеп чыгуу үчүн sequencer талап кылган болжолдонгон максаты болуп саналат. Учурда, прототибинин sequencer 1000 $ алда канча кымбат турган бүт генетикалык, аныктоо үчүн жыл талап кылынмак.
tSMSTM технологиялар боюнча өтүнмө, анын ичинде адамдардын генетикалык генеалогиялык аныктоо жана башка оорунун себептерин аныктоо үчүн түрлөрдүн, бактериялардын антибиотиктерге туруктуулук, тездик программалуу жана дагы көп. генетикалык ыкмалары көп колдонулган жөндөмдүү эмес culturable микроорганизмдер же учурдагы ыкмалар менен жалгыздыкка тыюу жер кыртышынын жана башка Matrices табылган аныктоо үчүн, ошондой эле зайым жок бир даана генди аныктоо жөндөмдүүлүгү, айлана-чөйрөнү Микробиология боюнча көптөгөн пайдалары бар. Мындан тышкары, айлана-чөйрөнү коргоо үлгүлөрдү мүнөзү тез жугуучу маселелери, УРК колдонуп ген зайым үчүн кыйынчылыктарды туудурат. Бирок, бул кыйынчылык да кийлигишүүсүз иштеши tSMSTM колдонулган полимераз энзимдердин үчүн өтүү керек эле.
бир молекула тартибин артында теориясы кыйла негизги болуп саналат, бирок муну эч ким мурда аны ойлонуп, эмне деп ойлошу мүмкүн. Бул жөнөкөй көрүнгөнү менен, ал жерде көп техникалык компоненттери, мисалы, аянтчаларды жана Helicos менен алек, анын ичинде жаңы химиялык кубулуштардын жана реагенттердин өнүктүрүү үчүн кыйынчылыктар көп иштеп чыгуу менен алек болуп, пластина жана жогорку өткөрүү окурмандар. Бир негизде бир классын химиялык аныктоо жөндөмү өтө сезимтал инструменталдык талап кылат, ал эми азык- жана аныктоо сигналдарды химия ал жылбай калыптар колдонулат жана белгиленген сыяктуу тоскоолдуктарды азайтуу жана ДНК полимераз берилгендикти оптималдаштыруу туура болушу керек нуклеотиддер. Алар бир күнү $ 1000, 1-күн өзү адамдын геномун же жеткирүүгө деген үмүт менен бул технологиясын иштеп жатат деп Helicos тарабынан кыйынчылыктарга дуушар болуп саналат.